Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tcea2Q9QVN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcea2Q9QVN7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcea2Q9QVN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms