Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trpc4apQ9JLV2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Trpc4apQ9JLV2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trpc4apQ9JLV2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trpc4apQ9JLV2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms