Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkd2l2Q9JLG4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkd2l2Q9JLG4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms