Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tlr5Q9JLF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tlr5Q9JLF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tlr5Q9JLF7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms