Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TefQ9JLC6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TefQ9JLC6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TefQ9JLC6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms