Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nectin3Q9JLB9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nectin3Q9JLB9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nectin3Q9JLB9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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