Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gde1Q9JL56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gde1Q9JL56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gde1Q9JL56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms