Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot9Q9JKY0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot9Q9JKY0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms