Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ldb3Q9JKS4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ldb3Q9JKS4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms