Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx6Q9JKK1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx6Q9JKK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx6Q9JKK1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms