Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl39Q9JKF7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Mrpl39Q9JKF7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms