Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trem3Q9JKE1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trem3Q9JKE1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms