Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Msgn1Q9JK54 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Msgn1Q9JK54 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msgn1Q9JK54 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms