Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Alyref2Q9JJW6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Alyref2Q9JJW6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms