Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Oxct2aQ9JJN4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Oxct2aQ9JJN4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Oxct2aQ9JJN4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms