Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efcc1Q9JJF6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efcc1Q9JJF6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efcc1Q9JJF6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms