Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpf2Q9JJ80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpf2Q9JJ80 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpf2Q9JJ80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms