Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIZ0

Cml1, Probable N-acetyltransferase CML1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml1Q9JIZ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cml1Q9JIZ0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cml1Q9JIZ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms