Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smco4Q9JIS3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smco4Q9JIS3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms