Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcirg1Q9JHF5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcirg1Q9JHF5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcirg1Q9JHF5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms