Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ropn1Q9ESG2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ropn1Q9ESG2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ropn1Q9ESG2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ropn1Q9ESG2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1Q9ESG2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1Q9ESG2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms