Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim54Q9ERP3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim54Q9ERP3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim54Q9ERP3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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