Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dap3Q9ER88 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dap3Q9ER88 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms