Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RhojQ9ER71 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RhojQ9ER71 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RhojQ9ER71 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms