Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col4a3bpQ9EQG9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a3bpQ9EQG9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms