Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r53Q9EP93 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r53Q9EP93 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r53Q9EP93 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms