Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ap3s1Q9DCR2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ap3s1Q9DCR2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms