Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smdt1Q9DB10 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms