Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Asf1bQ9DAP7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Asf1bQ9DAP7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms