Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc89Q9DA73 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc89Q9DA73 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc89Q9DA73 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms