Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem239Q9DA47 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem239Q9DA47 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms