Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Efhc1Q9D9T8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efhc1Q9D9T8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhc1Q9D9T8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms