Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9D9D9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9D9D9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9D9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9D9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9D9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9D9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9D9D9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q9D9D9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9D9D9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D9D9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9D9D9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9D9D9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134 ms