Protein–RNA interactions for Protein: Q9D979

Uncharacterized protein C17orf64 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D979 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D979 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9D979 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9D979 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D979 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D979 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D979 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D979 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9D979 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D979 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D979 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D979 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D979 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Q9D979 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9D979 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D979 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D979 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D979 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9D979 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9D979 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9D979 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9D979 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D979 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D979 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D979 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9D979 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9D979 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9D979 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9D979 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D979 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D979 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D979 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D979 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D979 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9D979 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9D979 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms