Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atg7Q9D906 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atg7Q9D906 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atg7Q9D906 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms