Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y7

Tnfaip8l2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tnfaip8l2Q9D8Y7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms