Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot8Q9D8X5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms