Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tvp23bQ9D8T4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tvp23bQ9D8T4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms