Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms