Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp4bQ9D8B3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp4bQ9D8B3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms