Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn9Q9D805 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn9Q9D805 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn9Q9D805 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms