Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tspan17Q9D7W4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tspan17Q9D7W4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tspan17Q9D7W4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms