Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Capns2Q9D7J7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Capns2Q9D7J7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Capns2Q9D7J7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms