Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cnbd2Q9D5U8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnbd2Q9D5U8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms