Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PrameQ9D4Z5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrameQ9D4Z5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrameQ9D4Z5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms