Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms