Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lonrf3Q9D4H7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lonrf3Q9D4H7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms