Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gcc1Q9D4H2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gcc1Q9D4H2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gcc1Q9D4H2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms