Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tubgcp4Q9D4F8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubgcp4Q9D4F8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms