Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4933425L06RikQ9D3Z8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms